三氮唑在環(huán)肽中的應用及結構分析
在蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(PDB)中,約有四分之一的蛋白質(zhì)(多肽)包含至少一個二硫鍵。被二硫鍵限制結構的多肽通常具有更好的化學穩(wěn)定性、代謝穩(wěn)定性,以及更好的跨膜運輸能力和更強的底物親和力,因此,環(huán)肽是當前藥物開發(fā)的熱點。然而,生理條件下谷胱甘肽、血清白蛋白等硫醇化合物或氧化還原酶等物質(zhì)對二硫鍵的還原會導致蛋白質(zhì)構象改變,進而失活或發(fā)生代謝降解,限制了環(huán)肽作為藥物研發(fā)的潛力。
以結構穩(wěn)定的化合物取代二硫鍵是解決其氧化還原不穩(wěn)定性的方法之一。本文中,澳大利亞昆士蘭大學的DavidJ. Craik教授等通過骨架環(huán)化和RuAAC交聯(lián)反應將不同結構的三氮唑作為二硫鍵模擬物引入環(huán)肽,合成了一系列活性絲氨酸蛋白酶抑制劑,并對蛋白酶-抑制劑復合物結構進行了詳細表征。
:含三氮唑(藍色)和二硫鍵(黃色)的環(huán)肽在晶體結構上高度吻合
向日葵胰蛋白酶抑制劑(sunflowertrypsin inhibitor-1, SFTI-1)是迄今為止發(fā)現(xiàn)的抑制活性較高的天然胰蛋白酶抑制劑(Ki< 20 pm),屬于Bowman-Birk抑制劑(BBI)家族,由14個氨基酸(GRCTKSIPPICFPD)和1個二硫鍵組成。由于 SFTI-1具有小、完整的環(huán)狀多肽結構,因此以它為模板研發(fā)新型高效的抑制劑已成為藥物研發(fā)的一個重要方向。作者以SFTI-1為模型蛋白,設計不同結構的橋連三氮唑取代二硫鍵,并探究其對SFTI-1活性的影響。
RuAAC(釕)和CuAAC(銅)均可催化疊氮對末端炔烴的環(huán)加成,分別得到1,5和1,4-二取代-1,2,3-三氮唑?;诖?,作者利用SPPS合成了不同原子數(shù)目和唑環(huán)方向的環(huán)肽1b,1c(1,5-三氮唑)和1d,1e,1f(1,4-三氮唑)。對以上5種變體進行胰蛋白酶抑制活性測定,作者觀察到1,5-三氮唑變體(1b-1c)表現(xiàn)出比1,4-三氮唑變體(1d-1f)更強的抑制活性。其中,1b相比于原始SFTI-1(1a)活性約有5倍的降低,表現(xiàn)出了高程度的二硫鍵模擬。
除胰蛋白酶外,改造后的SFTI變體2a,3a,4a可分別作為人激肽釋放酶7(KLK7)、纖維蛋白溶解酶(plasmin)、蛋白裂解酶(matriptase)的蛋白酶抑制劑。類似前述的合成和活性測定實驗,作者篩選出三種變體2b(KLK7),3b(plasmin),4b(matriptase),可針對三種蛋白酶實現(xiàn)有效的活性抑制。由此,作者共得到四種引入橋連三氮唑的蛋白酶抑制劑(1b-4b)進行下一步研究。